孕婦感染弓形蟲可威脅胎兒，由血行播散而導致流產、早產、死胎及胎兒感染等。孕婦感染時的孕齡越大則越易傳染給胎兒。及時發現治療越早，后遺癥出現越少。

孕早期感染，因弓形蟲難以通過胎盤，所以僅有15%的新生兒會出現先天感染，但由于這時胎兒抵抗力差，基本上都是致命性的，多表現為流產或胚胎停止發育。

孕中期感染，25%左右的新生兒會受到感染，多表現為妊娠晚期流產或胎死宮內，成活胎兒多伴有先天性出生缺陷。

孕晚期感染，胎兒受累的危險高達60%，表現為胎死宮內、早產。僥幸存活的胎兒，絕大多數伴有嚴重的神經系統障礙和其他出生缺陷。