既然苦蕎麥殼與甜蕎麥殼是兩種是不一樣的事物，那么苦蕎麥殼與甜蕎麥殼之間有什么區別呢？

蕎麥殼有平肝潛陽，清熱安神，瀉火解毒的作用。這里說的主要是甜蕎麥殼。韓國、日本進口中國的蕎麥殼也是用的是內蒙古赤峰出口級甜蕎麥殼。

蕎麥殼可以用來做枕頭，做枕頭的話苦蕎麥和甜蕎麥兩者的含量相差不多，都是很高的了，已經超出正常使用需求，但苦蕎的透氣性要差好多，也硬好多，稍帶味道不如甜蕎，這也是苦蕎麥殼要比甜蕎便宜好多的原因。

甜蕎麥又稱蕎麥，甜蕎麥具有獨特的藥用價值，對防治高血壓、肺結核、消化道感染、脫發等疾病有療效，尤其對治療高血壓、糖尿病有特效，還能預防心腦血管疾病。

相比于甜蕎麥，苦蕎麥中還含有其它谷類作物缺乏的硒，有利于防癌。硒在人體內與金屬相結合形成一種不穩定的"金屬一硒一蛋白"復合物，有助于排解人體中的有毒物質 (如鉛、汞、鎬等)。