存儲新鮮羅漢果，首先要保證羅漢果的外殼完整不破裂，否則羅漢果很快就會發霉，就算是這樣，新鮮羅漢果也不能長時間在重溫環境放置，要長時間保存，要放在冰箱里冷藏，用到的時候再拿出來。新鮮的羅漢果在常溫下可保存30天，在低溫下可保存90天。

還有一種長期的保存方法就是就新鮮的羅漢果烘干。如果不介意新鮮的羅漢果變成干羅漢果的，最好這么保存。