第二次：妊娠11-13+6周，能夠看到胎兒的整個身體，了解是單胎還是多胎；同時可以用產科測量值估算孕周大小，并對一些嚴重的結構畸形如無腦兒、聯體兒等的檢測。測量胎兒頸項透明層厚度（NT）是篩查唐氏綜合征等染色體異常的敏感指標。62%-80%的先天愚型胎兒可表現出NT增厚（大于3mm）。
孕媽媽在懷孕期間五次B超莫忽視
第三次：妊娠20-24周，這是胎兒畸形篩選的最理想時期。此時胎兒解剖結構已經形成并能為超聲所顯示，胎兒大小及羊水適中，受骨骼聲影的影響較小，圖像清晰，大部分胎兒畸形在此時期均能表現出來。故孕20-24周常規進行1次詳細的胎兒系統結構篩查，可發現大部分明顯的胎兒畸形（如無腦兒、腦膨出、開放性脊柱裂、胸腹壁缺損內臟外翻、單胸心、致命性軟骨發育不全等）。
第四次：妊娠30-34周，可再次評估胎兒生長發育情況，發現某些到孕晚期才表現出來的畸形。但此時羊水相對較少，胎兒相對較大，體位變動的機會更少，受身體遮擋導致胎兒畸形的發現率更低。
第五次：孕足月（37周以后）了解胎兒生長發育情況、羊水量及胎盤鈣化度，評估胎兒宮內安危情況。
任銀娟指出，超聲是一種間接的檢查方法，受儀器設備、胎兒姿勢、胎位、羊水量及母體腹壁厚度等多種因素，診斷符合率不可能達到100%。大部分染色體病、單基因及多基因病在胎兒時期無法通過超聲檢查發現。大約5%的畸形在晚期妊娠甚至出生后才表現出來，也有一定的局限性。
